Придавая большое значение развитию фундаментальной науки как основы экономического, социального и культурного развития России, Президент РСФСР издал Указ от 21 ноября 1991 года № 228 "Об организации Российской академии наук".

Научная база Дальневосточного отделения академии наук создана прочная. Ныне действуют 35 научных учреждений, расположенных в шести территориальных научных центрах (Амурском научном центре, Камчатском научном центре, Приморском научном центре, Сахалинском научном центре, Северо-Восточном научном центре, Хабаровском научном центре).

В ДВО насчитывается 7435 чел., в том числе 1461 научный сотрудник, среди них 13 академиков, 20 членов-корреспондентов, 271 доктор наук и 1157 кандидатов наук.

Усилия ученых сконцентрированы на изучении геолого-геофизических закономерностей эволюции и строения зоны перехода от континента к океану, разработке научных основ технологий комплексной переработки минерального сырья, проблемах автоматизации и создании экспертных систем, развитии коммуникационных систем, оценке сейсмической и вулканической опасности, фундаментальных исследованиях биоразнообразия, эволюции и экологии растительного и животного мира дальневосточного региона, изучении основ молекулярной организации морских биологических систем, исследовании в области молекулярной иммунологии, биотехнологии, океанологии, океанографии, истории и этнографии.

Институты ДВО ведут исследования по 326 темам НИР.

Давние творческие связи связывают Дальневосточное отделение РАН и Дальневосточный государственный университет. Академические профессоры читали лекции в вузе, студенты участвовали в академических экспедициях, приобщались к исследованиям знаменитых научных школ. После известного поворота Российской истории эта взаимосвязь стала менее прочной. Ведь помимо творческих контактов для совместной работы нужны еще и деньги, а их стало не хватать. И тут появилась Федеральная целевая программа "Государственная поддержка интеграции высшего образования и фундаментальной науки в 1997-2000 гг.". ДВО и ДВГУ совместно с другими вузами подготовили под нее ряд значительных проектов, которые успешно прошли конкурсный отбор и получили финансовую поддержку.

Победителями "Интеграции" стали 37 проектов, что выдвинуло регион на одно из ведущих мест в России по количеству и качеству интеграционных проектов.