В 1949 г. по ходатайству Президиума АН СССР был восстановлен Дальневосточный филиал АН СССР, которому было присвоено имя академика В. Л. Комарова. Филиал становится ведущим научно-исследовательским центром Академии наук на берегах Тихого океана. В его составе было 9 отделов, несколько самостоятельных лабораторий, Горно-таежная станция, Служба Солнца, Ботанический сад, заповедники и ряд других подразделений.

В это же время создается Сахалинский филиал АН СССР, который в дальнейшем (в 1955 г.) преобразуется в Сахалинский комплексный научно-исследовательский институт АН СССР. Это был первый академический институт, созданный в послевоенное время на Дальнем Востоке.