15 января руководитель ФАНО России Михаил Котюков и Президент Российской академии наук Владимир Фортов подписали 6 регламентов по ключевым направлениям взаимодействия:

– по вопросам  создания, реорганизации и ликвидации научных организаций, подведомственных ФАНО России; 

– по вопросам проведения оценки результативности  деятельности научных организаций, подведомственных ФАНО России;

– по вопросам осуществления и развития международного научного и научно-технического сотрудничества;  

– по вопросам совершенствования инфраструктуры обеспечения научной и научно-технической деятельности в Российской Федерации в части планирования развития материально-технической базы;

– по подготовке и предоставлению научными организациями, подведомственными ФАНО России, отчетов о выполнении плана научно-исследовательских работ; 

– по взаимодействию со средствами массовой информации; 

В сентябре 2014 года ФАНО России и РАН заключили соглашение о сотрудничестве. Соглашение направлено на выстраивание эффективного взаимодействия и создание условий для проведения и координации научных исследований в области естественных, технических, медицинских, сельскохозяйственных, общественных и гуманитарных наук, проводимых научными организациями, подведомственными ФАНО России.

Ранее в рамках соглашения были утверждены два регламента: Регламент взаимодействия ФАНО России и РАН по формированию и утверждению государственных заданий на проведение научных исследований научными организациями, созданными в форме бюджетных и автономных учреждений и подведомственными ФАНО России и Регламент взаимодействия ФАНО России и РАН по согласованию и утверждению кандидатур на должность руководителя научной организации. В настоящее время завершается обсуждение проекта регламента о разработке плана проведения фундаментальных и поисковых исследований научными организациями, подведомственными ФАНО России в рамках выполнения программы фундаментальных исследований в Российской Федерации на долгосрочный период.