Лауреаты премии ДВО РАН имени выдающихся учёных Дальнего Востока России
Группа учёных Тихоокеанского института биоорганической химии им. Г.Б.Елякова ДВО РАН стала лауреатами премии ДВО РАН имени выдающихся учёных Дальнего Востока России в 2024 году: Маргарите Михайловне Монастырной, Ирине Николаевне Гладких и Римме Сергеевне Калиной присуждена премия имени академика Г.Б. Елякова за цикл работ «Молекулярные мишени и биологическая активность APETx-подобных пептидов морской анемоны Heteractis magnifica».
Авторы – выпускники кафедр органической и биоорганической химии Дальневосточного государственного университета, доктор химических наук Маргарита Михайловна Монастырная (год выпуска – 1972), кандидат химических наук Ирина Николаевна Гладких (год выпуска – 2004) и кандидат химических наук Римма Сергеевна Калина (год выпуска – 2014). С момента прихода в лабораторию химии пептидов (ЛХП), возглавляемую доктором химических наук Эммой Павловной Козловской, посвятили свои исследования изучению структуры и функции биологически активных веществ (БАВ), продуцируемых морскими гидробионтами, в частности, морскими анемонами.
И.Н. Гладких и Р.С. Калина в настоящий момент являются сотрудницами недавно созданной в институте молодёжной лаборатории молекулярной фармакологии и биомедицины (ЛМФБМ), продолжающей исследования, начатые в ЛХП, а М.М. Монастырная исполняет обязанности заведующего ЛХП.
В исследовании, за которое М.М. Монастырная, И.Н. Гладких и Р.С. Калина, будучи основными авторами вышеназванного цикла работ, получили премию имени академика РАН Г.Б. Елякова, принимал участие большой коллектив исследователей из нескольких лабораторий института: специалисты биоорганики, молекулярные и клеточные биологи, биохимики, электрофизиологи, биофизики, компьютерные моделисты.
Как рассказали наши героини, основное направление деятельности лаборатории химии пептидов было инициировано ещё в конце 70-х годов прошлого века вице-президентом АН СССР академиком АН СССР Ю.А. Овчинниковым и директором ТИБОХ ДВНЦ АН СССР в то время членом-корреспондентом АН СССР Г.Б. Еляковым, основателем института. Георгий Борисович в 1978 году создал группу, а позже лабораторию химии пептидов (ЛХП) для её участия во Всесоюзной научно-исследовательской программе АН СССР «Ионный канал». Программа была призвана установить закономерности ионного и молекулярного транспорта через биологические мембраны, в частности, ионные каналы и ионотропные рецепторы – белки клеточных мембран, участвующие в разнообразных физиологических процессах организма (таких как восприятие, обработка и передача внешних стимулов/сигналов в центральную нервную систему), нарушение функционирования которых связано с развитием тяжёлых патологических состояний.
– Целью программы явился поиск и установление структуры и механизма взаимодействия с каналами экзогенных белково-пептидных лигандов, продуцируемых главным образом ядовитыми организмами. Токсичные и нетоксичные пептиды и полипептиды ядов имеют удивительное структурное разнообразие и обладают уникальными видами биологической активности и, зачастую, высокоспецифичны к своим биологическим мишеням (потенциал-зависимым натриевым, калиевым, кальциевым, кислото-чувствительным ионным каналам, ваниллоидному рецептору и т.д.). Эти лиганды способны модифицировать, оказывать блокирующий или активирующий эффект на работу различных типов и подтипов ионных каналов и тем самым уменьшать восприятие болевых стимулов, обусловленных изменением температуры, давления, рН среды и других стимулов, действующих на организм и вызывающих его патологические состояния, то есть восстанавливать функциональную активность каналов, – пояснила Маргарита Михайловна.
Основными направлениями исследований ЛХП (а позднее и ЛМФБМ) являлся поиск и изучение структуры и функции новых перспективных биологически активных пептидов морских анемон – кандидатов для получения на их основе селективных модификаторов ионных каналов и ионотропных рецепторов, а также ингибиторов воспалительных протеиназ. К настоящему времени для проведения фармакологических исследований из морской анемоны H. magnifica выделено нескольких структурных типов природных пептидов, установлены их первичные и пространственные структуры. Определена их биологическая in vivo и in vitro активность. Проведено in silico предсказание возможных мишеней и электрофизиологическое исследование механизмов взаимодействия с рядом биологических мишеней, для чего были созданы генно-инженерные конструкции и осуществлена экспрессия активных рекомбинантных аналогов исследуемых пептидов: так называемых APETx-подобных пептидов, ингибирующих (блокирующих или активирующих) некоторые подтипы кислото-чувствительных каналов (ASICs); нейротоксинов 2 структурного типа, блокирующих потенциал-зависимые натриевые каналы; полифункциональных ингибиторов протеиназ, взаимодействующих также с потенциал-зависимыми калиевыми каналами и TRPV1-рецептором.
На основе исследуемых пептидов могут быть созданы анальгетические препараты нового поколения, избирательно действующие на определённые типы ионных каналов и рецепторов, участвующих в болевых процессах.
Морские анемоны − широко распространённое в Мировом океане семейство кишечнополостных организмов, насчитывающее более тысячи видов. Эти животные напоминают прекрасные цветы, «лепестками» которых являются многочисленные щупальца, снабжённые специализированными стрекательными клетками, содержащими смесь ядовитых веществ, с помощью которых анемоны охотятся на своих жертв и/или защищаются от потенциальных врагов, выстреливая содержимое стрекательных клеток в приближающуюся жертву и парализуя её своим ядом.
– Как вы пришли к такому неординарному объекту исследования – морской анемоне? – обращаюсь к Маргарите Михайловне Монастырной.
– Более полувека назад анемоны привлекли внимание исследователей в связи с развитием морского дайвинг-туризма и наличием зачастую смертельной опасности при случайной встрече купальщиков с этими стрекающими животными. Морские анемоны являются распространёнными кишечнополостными залива Посьет в Японском море, и потому неудивительно, что именно нашему институту была поручена в своё время вышеназванная задача поиска БАВ в ядовитых анемонах для их использования в исследованиях по программе «Ионный канал».
– Какие подходы, методы вы использовали для их решения своих задач?
– В поиске подходов и направлений исследований мы руководствовались традиционными для биоорганической химии и физико-химической биологии методами и подходами. Поиск и выделение новых пептидных лигандов анемон, изучение их структуры и механизма взаимодействия с потенциальными мишенями проводился нами на основании литературных данных и согласно опубликованным результатам зарубежных коллег. А к концу 70-х годов прошлого столетия уже появились экспериментальные данные по ряду структур и биологической активности нескольких пептидов анемон, имелись также первые данные по установлению их мишеней для проведения сравнительных структурно-функциональных исследований.
– Где ещё занимаются подобными исследованиями?
– Дальнейшим развитием темы, получением новых нативных, рекомбинантных и мутантных лигандов и данных по их новым биологическим мишеням занимались и продолжают заниматься в настоящее время несколько зарубежных исследовательских коллективов, а также наши лаборатории (совместно с коллегами из Института биоорганической химии имени академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН и Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» (Москва).
– Маргарита Михайловна, по каким принципам, показаниям происходил отбор пептидов и биологических мишеней?
– Отбор БАВ проводится, как правило, традиционными методами химии белков, а это измельчение, экстракция, хроматография на различных носителях, тестирование биологической активности на экспериментальных животных и различных типах и подтипах ионных каналов и рецепторов, а также различных клеточных культурах. Результаты тестирования позволили установить, с какими биологическими мишенями взаимодействуют те или иные лиганды и определить величину их биологической активности.
– Как проявляются специфические взаимодействия между пептидами и биологическими мишенями? Каким образом можно использовать понимание механизмов таких взаимодействий?
– Согласно полученным экспериментальным данным, устанавливается наличие или отсутствие специфичности связывания лигандов с различными мишенями с помощью различных методов и моделей биологического тестирования. В наших исследованиях были использованы модели анальгетической, противовоспалительной, анксиолитической, антиопухолевой активности, а также ряд других, что позволило определить потенциальные биологические мишени, в то время как применение методов и подходов компьютерного моделирования (сайт-направленный мутагенез, молекулярный докинг) – установить сайты связывания с ними. Совокупность полученных данных позволяет наметить дальнейшие направления структурно-функциональных исследований лигандов, в том числе фармакологических, и участие в них определённых ионных каналов.
– Что даёт понимание закономерностей, выявленных в процессе ваших исследований?
– Выявленные закономерности взаимодействия пептидных лигандов с биологическими мишенями, в частности, кислото-чувствительными (ASICs) каналами, позволяет углублять фундаментальные знания о механизмах их функционирования, предлагать, находить и экспрессировать новые рекомбинантные аналоги пептидов (лигандов) для получения на их основе фармакологических препаратов направленного действия с заданными свойствами.
– Какой период времени охватывают ваши работы? Как формировались, изменялись цели и задачи цикла работ?
– Различные этапы исследований по данному направлению, начатому более 10 лет назад, проводились коллективом на протяжении последних трёх-четырёх лет. Эти исследования расширялись за счёт появления новых рекомбинантных аналогов APETx-подобных пептидов и различных подтипов ASICs каналов с целью выяснения специфики и механизмов белок-лигандных взаимодействий.
– Если говорить о практическом значении полученных результатов – получения фармакологических препаратов направленного действия, для лечения каких заболеваний они могут быть применены?
– Это заболевания, вызываемые нарушением функционирования ASICs каналов, которые связаны с закислением содержащих их органов и тканей (тканевый ацидоз, вызываемый травмами, воспалениями), с ишемией, с нарушениями нервной ткани (центральной и/или периферической нервной системы). Поскольку ASICs участвуют в физиологических процессах, связанных с работой головного мозга, нарушения мозговых функций вызывают ухудшение и потерю нейропластичности, памяти, способности к обучению, появлению страхов и других нейродегенеративных процессов.
– Какие задачи планируете решать в ближайшем будущем?
– Задачи и направления расширяющихся исследований могут привести к созданию новых анальгетиков селективного действия, на основе которых в дальнейшем планируется разработать и получить фармакологические препараты нового поколения, лишённые побочных эффектов.
Материал подготовила Анастасия КУЛИКОВА
Фото предоставлены Маргаритой МОНАСТЫРНОЙ